Analis Molecular Docking bertanggung jawab melakukan simulasi interaksi antara molekul ligan dengan target biologis (protein/enzim) secara in silico guna memprediksi afinitas, posisi ikatan, dan mekanisme interaksi. Peran ini penting untuk mendukung riset penemuan obat, eksplorasi senyawa bioaktif alam, serta validasi hipotesis dalam bidang kimia medisinal dan biologi struktural.

Layanan yang diberikan:
1) Pencarian dan penyaringan struktur target protein (dari PDB)
	• Desain atau konversi struktur senyawa ligan (dari PubChem, ChemDraw, dsb.)
2) Simulasi Molecular Docking
	• Setting parameter grid box dan center binding site
	• Docking menggunakan software: AutoDock Vina, PyRx, atau GOLD (by request)
	• Uji beberapa pose ligan untuk identifikasi interaksi optimal
3) Analisis dan Interpretasi Hasil
	• Identifikasi dan klasifikasi jenis interaksi (H-bond, hidrofobik, π-π, dll.)
	• Penilaian binding affinity dan ranking potensi senyawa
	• Perbandingan antar senyawa (jika multiligan)
4) Visualisasi Interaksi Molekuler
	•	Gambar 2D dan 3D interaksi ligan-protein
	•	Penyusunan ilustrasi dengan tools: Discovery Studio
5) Penyusunan Laporan Lengkap

Langkah Pekerjaan
1. Diskusi
2. Pengiriman invoice dan Pembayaran
3. Pengerjaan
4. Pengiriman hasil
5. Review hasil dan menerima hasil pekerjaan

Analisis Molecular Docking

Saya seorang PhD dibidang ilmu kimia dan farmasi pada salah satu perguruan tinggi. Saya menawarkan beberapa analisa termasuk spektroskopi NMR, IR, MS, UV-Vis, ECD dan Crystallography. Analisa spektroskopi, saya menawarkan bantuan dalam elusidasi struktur kimia organik serta molecular docking.

Langkah Pekerjaan
1. Klien berdiskusi terlebih dahulu
2. Memberikan data yang dibutuhkan
3. Pengerjaan sesuai tenggat waktu
4. Pelaporan
5. Mentoring (pada paket elusidasi struktur)